ในระยะแรกนี้สสวท.ได้เชิญมหาวิทยาลัยราชภัฏ 9 แห่งซึ่งเป็นเครือข่ายระดับอุดมศึกษาของ โครงการ เข้ามีส่วนร่วมในการดำเนินงานพัฒนาการเรียนการสอนโครงการห้องเรียนพิเศษวิทยาศาสตร์ ทั้งด้านการเป็นเครือข่ายแกนนำจัดอบรมครูของโรงเรียนในโครงการ พัฒนากิจกรรมการเรียนรู้ การจัดค่ายวิทยาศาสตร์ โครงงานวิทยาศาสตร์ และส่งเสริมให้นักเรียนได้ใช้ห้องปฏิบัติการวิทยาศาสตร์ของมหาวิทยาลัยเพื่อฝึกฝนสร้างทักษะกระบวนการเรียนรู้ทางวิทยาศาสตร์อย่างแท้จริง และรองรับงานบริการวิชาการทางวิทยาศาสตร์ คณิตศาสตร์ และเทคโนโลยีที่จะมีขึ้นในอนาคต
นอกจากนี้ยังได้ร่วมกับมหาวิทยาลัยราชภัฏเสริมความเข้มแข็งให้นักศึกษาที่จะเป็นครูคณิตศาสตร์ในอนาคต เนื้อหาเรื่องการสำรวจพีชคณิต และการสำรวจ Precalculus ด้วยโปรแกรม The Geometer’s Sketchpad (GSP) ซึ่งเป็นเรื่องยากให้เข้าใจได้ง่ายยิ่งขึ้น และเรียนรู้ด้วยการสืบเสาะ สำรวจโดยใช้สื่อการสอนที่มีศักยภาพสูงช่วยยกระดับคุณภาพการเรียนอย่างมีประสิทธิภาพ