สาเหตุเบื้องต้นสันนิษฐานว่ามีอุปกรณ์รั่วและเกิดการติดไฟที่หอแยกน้ำมันก๊าดในหน่วยกลั่นที่ 3 ขนาดกำลังการผลิต 80,000 บาร์เรลต่อวัน หน่วยกลั่นอื่นไม่ได้รับความเสียหาย คาดว่าจะหยุดเดินเครื่องหน่วยกลั่นเพื่อตรวจสอบสาเหตุและประเมินความเสียหายของอุปกรณ์ประมาณ 7 วัน โดยบริษัทฯ ได้ทำประกันภัยครอบคลุมทั้งในส่วนความเสียหายของทรัพย์สินและการหยุดชะงักของธุรกิจไว้แล้ว ทั้งนี้ การหยุดเดินเครื่องดังกล่าวไม่ส่งผลกระทบต่อการจำหน่ายผลิตภัณฑ์ให้แก่ผู้บริโภคแต่อย่างใด
ทั้งนี้ หลังเกิดเหตุเจ้าหน้าที่กรมควบคุมมลพิษเข้ามาตรวจสอบคุณภาพด้านสิ่งแวดล้อม จากเครื่องตรวจวัดคุณภาพน้ำและอากาศ ที่ติดตั้งในบริเวณชุมชนรอบโรงกลั่นและแฟลตของกำลังพลสังกัดสำนักงานปลัดกระทรวงกลาโหม พบว่าคุณภาพอากาศในช่วงที่เกิดเหตุไม่เกินค่ามาตรฐานที่กฎหมายกำหนดแต่อย่างใด
นอกจากนี้ บริษัท บางจากฯ ได้ส่งเจ้าหน้าที่กว่า 100 คน ออกสำรวจผลกระทบและทำความเข้าใจกับชุมชนรอบโรงกลั่น เพื่อให้มั่นใจว่าจะได้รับการดูแลอย่างทั่วถึง และพร้อมที่จะให้การช่วยเหลือหากพบว่าได้รับผลกระทบจากกรณีดังกล่าว