โดยมอบหมายให้สำนักส่งเสริมและสนับสนุนอาหารปลอดภัย (สสอป.) เป็นหน่วยงานกลางประสานความร่วมมือการทำงานด้านระบบคุณภาพงานอาหารปลอดภัยกับทุกหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง ทั้งส่วนกลาง ส่วนภูมิภาค ในและนอกสังกัดกระทรวงสาธารณสุข รวมทั้งการสนับสนุนส่งเสริมมาตรฐานวิธีการปฏิบัติงานอาหารปลอดภัยของสำนักงานสาธารณสุขทุกแห่ง และตรวจติดตามประเมินผล เพื่อให้การรับรองการทำงานของสำนักงานสาธารณสุขจังหวัดทั่วประเทศ ในเรื่องมาตรฐานระบบงานอาหารปลอดภัย ตามกฎอนามัยระหว่างประเทศ พ.ศ. 2558 (IHR, 2005)
ด้าน นางจงกลนี วิทยารุ่งเรืองศรี ผู้อำนวยการสำนักส่งเสริมและสนับสนุนอาหารปลอดภัย (สสอป.) สำนักงานปลัดกระทรวงสาธารณสุข ได้กล่าวเพิ่มเติมว่า การตรวจติดตามประเมินผล ระบบคุณภาพอาหารปลอดภัยจังหวัด ปัจจุบันได้มีการสุ่มลงพื้นที่เพื่อตรวจประเมินการทำงานระบบอาหารปลอดภัยของสาธารณสุขจังหวัดไปแล้วหลายจังหวัด อาทิ เชียงราย พิจิตร พิษณุโลก ลำปาง ขอนแก่น อุบลราชธานี และนครพนม คาดว่าจะสามารถประเมินผลทั้งการสุ่มลงพื้นที่ และประเมินจากเอกสารได้ครบทุกจังหวัดในปีงบประมาณ 2557 นี้ ซึ่งการประเมินระบบการทำงานระบบคุณภาพอาหารปลอดภัยจังหวัด ยังคงยึดใน 4 ระบบ คือ 1. นโยบายและการบริหารจัดการ 2.การปฏิบัติการโดยจะต้องมี ระบบป้องกัน ระบบเฝ้าระวัง และระบบตอบโต้ 3. การทบทวนและการประเมินผล 4. เอกสารบันทึกและรายงานรวมทั้งการเก็บรักษา โดยหน่วยงานที่ผ่านเกณฑ์การประเมินระบบคุณภาพงานอาหารปลอดภัยจะต้องได้คะแนนรวมไม่ต่ำกว่าร้อยละ 80 ในส่วนของการประเมินระดับสมรรถนะอาหารปลอดภัยที่ผ่านมา พบจุดเด่นจุดด้อยที่แตกต่างกันไปในแต่ละจังหวัด เนื่องด้วยในแต่จังหวัดมีทรัพยากรอาหาร มีคณะทำงาน มีสภาพปัญหาที่แตกต่างกันตามบริบทของแต่ละพื้นที่ แต่อย่างไรก็ตามถือว่าเป็นการเริ่มต้นที่ดี เพราะมีการบูรณาการด้านอาหารปลอดภัยตลอดห่วงโซ่อาหารทุกๆ จังหวัด สามารถตอบโจทย์ตามมาตรฐานสากลของ WHO ซึ่งประโยชน์ที่ได้ส่งผลดีให้ประชาชนหรือผู้บริโภคได้บริโภคอาหารสะอาด ปลอดภัย ไม่บริโภคอาหารก่อโรค ประชาชนจึงมีสุขภาพและคุณภาพชีวิตดีขึ้น ลดภาระค่าใช้จ่ายด้านการรักษาพยาบาล ลดการสูญเสียทั้งด้านเศรษฐกิจและสังคมโดยรวมของประเทศ