อย่างไรก็ตาม จากการดำเนินงานที่ผ่านมา พบว่ายังไม่มีหน่วยงานกลางที่รับผิดชอบในการจัดทำยุทธศาสตร์การวิจัยร่วมกันโดยตรง โดยหน่วยงานต่างๆ ภายใต้กระทรวงเกษตรฯ มีการดำเนินงานด้านการวิจัยเฉพาะในแต่ละหน่วยงาน ดังนั้น เพื่อให้การดำเนินงานด้านการวิจัยและพัฒนาด้านการเกษตรและอุตสาหกรรมการเกษตร ของกระทรวงเกษตรฯ มีทิศทางและเป้าหมายในการดำเนินงานร่วมกัน ที่ประชุมจึงได้เห็นชอบให้สำนักงานพัฒนาการวิจัยการเกษตร (องค์การมหาชน) หรือ สวก. จัดทำร่างยุทธศาสตร์การวิจัยด้านการเกษตรและอุตสาหกรรมการเกษตร กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ พ.ศ.2558-2564 และได้เห็นชอบในหลักการของร่างยุทธศาสตร์การวิจัยดังกล่าว เพื่อพัฒนาและสร้างความเข็มแข็งด้านการวิจัยและพัฒนาด้านการเกษตรให้กับประเทศ และส่งเสริมการบูรณาการงานวิจัยจากหน่วยงานต่างๆ ในสังกัดกระทรวงเกษตรฯ ครอบคลุมในกลุ่มสินค้าเกษตรที่มีความสำคัญทางเศรษฐกิจ อาทิ สินค้าพืช ประมง และปศุสัตว์ โดยมีเป้าหมายเพื่อเพิ่มขีดความสามารถของประเทศในการเป็นผู้นำ และศูนย์กลางสินค้าเกษตรคุณภาพที่สำคัญในภูมิภาคอาเซียนและตลาดโลก ทั้งนี้ ได้มอบหมายให้คณะกรรมการขับเคลื่อนงานวิจัย กระทรวงเกษตรและสหกรณ์ จัดทำแผนปฏิบัติการ (Action Plan) ให้สอดคล้องกับร่างยุทธศาสตร์วิจัยด้านการเกษตรและอุตสาหกรรมการเกษตรฯ และจัดทำแนวทางการแปลงแผนสู่การปฏิบัติต่อไป
สำหรับร่างยุทธศาสตร์การวิจัยด้านการเกษตรและอุตสาหกรรมการเกษตร กระทรวงเกษตรฯ พ.ศ.2558-2564 มีการกำหนดยุทธศาสตร์การวิจัย กลยุทธ์ แนวทางการดำเนินงาน โดยคำนึงถึงปัจจัยที่สำคัญทั้งด้านเศรษฐกิจ ด้านสิ่งแวดล้อม และด้านสังคม เพื่อรองรับการเปลี่ยนแปลงตลาดในภูมิภาคอาเซียนและตลาดโลก การเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ การแก้ไขปัญหาขาดแคลนแรงงาน รวมทั้งเพื่อสร้างนวัตกรรมและเพิ่มมูลค่าสินค้าเกษตรและอาหารเชิงพาณิชย์ ซึ่งเมื่อดำเนินการภายใต้ยุทธศาสตร์นี้จะทำให้ได้กฎระเบียบ มาตรฐานที่สามารถยกระดับความสามารถในการผลิต และการตรวจสอบสินค้าเกษตรเพื่อรองรับการเปลี่ยนแปลงตลาดในภูมิภาคอาเซียนและตลาดโลก ได้เทคโนโลยีหรือวิธีการผลิตสินค้าเกษตรที่มีประสิทธิภาพ ได้นวัตกรรมองค์ความรู้ หรือต้นแบบผลิตภัณฑ์สินค้าเกษตรและอาหารที่มีมูลค่าสูง และมีศักยภาพในการแข่งขันเชิงพาณิชย์ ซึ่งจะเป็นการเพิ่มขีดความสามารถในการแข่งขันของสินค้าเกษตรไทย