ท่าน พรทิพย์ โรจน์ธำรงค์ เคยดำรงตำแหน่งเจ้าหน้าที่วิเคราะห์นโยบายและแผน กองบัญชีประชาชาติ สำนักงานคณะกรรมการพัฒนาการเศรษฐกิจและสังคมแห่งชาติ (สภาพัฒน์) และเป็นข้าราชการในชุดบุกเบิก 19 คนแรก ที่มาร่วมกันดำเนินการจัดตั้ง "สำนักงานสภาที่ปรึกษาเศรษฐกิจและสังคมแห่งชาติ" ตามพระราชบัญญัติสภาที่ปรึกษาเศรษฐกิจและสังคมแห่งชาติ พ.ศ. 2543 ซึ่งสำนักงานสภาที่ปรึกษาฯ เป็นส่วนราชการที่ไม่สังกัดสำนักนายกรัฐมนตรี กระทรวง หรือทบวง และมีฐานะเป็นกรมอยู่ภายใต้บังคับบัญชาของนายกรัฐมนตรี มีภารกิจเกี่ยวกับการสนับสนุนกิจการของสภาที่ปรึกษาฯ
ทั้งนี้ในระหว่างการปฏิบัติหน้าที่ที่สำนักงานสภาที่ปรึกษาฯ ท่านได้มุ่งมั่นทุ่มเทให้กับการทำงานในองค์กรแห่งนี้มาอย่างยาวนาน โดยได้ดำรงตำแหน่งที่สำคัญ อาทิ ผู้อำนวยการสำนักบริหารกลาง ผู้อำนวยการสำนักวิชาการ ผู้อำนวยการสำนักกิจการสภาที่ปรึกษาฯ และรองเลขาธิการสภาที่ปรึกษาฯ จวบจนท่านจะเกษียณอายุราชการในวันที่ 30 กันยายน พ.ศ. 2559 นี้