เรือ Silver Sea2 เป็นเรือจดทะเบียนไทย ประเภทเรือขนส่งสัตว์น้ำห้องเย็น มีคนประจำหรือทั้งสิ้น 19 คน เป็นคนไทย มีหนังสือเดินทาง และใบอนุญาตทำงานบนเรือถูกต้อง เมื่อวันที่ 12 สิงหาคม 2558 ขณะที่เรือ เดินทางจากน่านน้ำปาปัวนิวกินีกลับมายังประเทศไทย ผ่านน่านน้ำอินโดนิเซีย บริเวณ จังหวัดอาเจะห์ นอกฝั่งเกาะสุมาตรา ถูกทางการของอินโดนีเซีย สกัดกั้น และควบคุมเข้าไปยัง ม.ซาบัง แจ้งข้อหา
1. ไม่เปิดระบบติดตามเรือสำหรับ เรือประมง ผลการตัดสิน ไม่มีความผิด ต่อมาถูกตั้งข้อหาใหม่
2. ทำการประมงที่ไม่ได้รับใบอนุญาตจากรัฐบาลอินโดนีเซีย ศาลพิจารณาแล้ว ไม่มีความผิด จึงถูกตั้งข้อหาอีกครั้ง เป็นครั้งที่ 3
3. ทำการขนถ่ายสัตว์น้ำที่จับจากน่านน้ำอินโดนิเซีย ข้อหานี้อยู่ในระหว่างการดำเนินคดีของอินโดนีเซีย ซึ่งการสืบสวนตามกระบวนการยุติธรรมของทางการอินโดนีเซีย เนื่องจากตั้งข้อกล่าวหาใหม่ลูกเรือไม่รับอนุญาตให้ขึ้นฝั่ง
อย่างไรก็ดี มีการอนุญาตให้ทยอยส่งผู้ป่วยหนักกลับประเทศไทย โดยความคืบหน้าล่าสุด ณ วันที่ 3 กันยายน 2559 ส่งผู้ป่วยหนักกลับมาแล้ว 6 คน คงเหลือลูกเรืออีก 13 คน ซึ่งในวันจันทร์ที่ 31 ตุลาคม 2559 มีการส่งลูกเรือที่ไม่เกี่ยวกับคดีกลับประเทศไทยจำนวน 9 คน โดยการส่งกลับครั้งนี้เกิดจากการประสานงานของศูนย์บัญชาการแก้ไขปัญหาการทำประมงผิดกฎหมาย (ศปมผ) ได้ส่งเจ้าหน้าที่ไปทำการเจรจากับทางการอินโดนีเซีย บนพื้นฐานของกฎหมายอินโดนีเซียที่สามารถให้การช่วยเหลือได้ ซึ่ง ศปมผ. และกระทรวงการต่างประเทศ ได้ทำการติดตามและเจรจากับทางการอินโดนีเซีย บนพื้นฐานกฎหมายของอินโดนีเซีย และจะประสานงานกับหน่วยงานผู้เกี่ยวข้องอื่นๆ ให้ได้ทำการช่วยเหลือลูกเรือที่ยังเหลืออยู่ (ต้นหน ต้นเรือ ต้นกล และ กัปตัน) ให้ได้เร็วที่สุด ในโอกาสต่อไป