โดยการยื่นอุทธรณ์ในครั้งนี้เป็นผลสืบเนื่องจากเมื่อวันที่ 3 ธันวาคมที่ผ่านมา คณะอนุกรรมาธิการวิสามัญพิจารณาร่างพระราชบัญญัติงบประมาณรายจ่ายประจำปีงบประมาณ พ.ศ. 2563 มีมติปรับลดงบประมาณ ในส่วน กองทุน ววน. จากเดิม 12,554 ล้านบาท ปรับลดจำนวน 8,000 ล้านบาท ซึ่งการปรับลดดังกล่าวคิดเป็นสัดส่วนถึงร้อยละ 63.7 ของงบประมาณกองทุนฯ ที่จะส่งผลกระทบอย่างรุนแรงต่อการพัฒนาประเทศ กระทบต่อความเชื่อมั่นของประเทศในด้านการลงทุนในภาคอุตสาหกรรมที่จำเป็นต้องใช้เทคโนโลยีขั้นสูง และยังส่งผลกระทบเศรษฐกิจฐานราก ทั้งวิสาหกิจชุมชน SMEs จะขาดการยกระดับศักยภาพในการแข่งขัน รวมถึงกระทบมหาวิทยาลัยและหน่วยงานรวมทั้งสิ้นกว่า 250 หน่วยงานที่จำเป็นต้องใช้เงินจากกองทุนนี้ในการทำงานวิจัยเพื่อตอบโจทย์พัฒนาประเทศ
อย่างไรก็ตามจะเห็นได้ว่า การปรับลดงบประมาณจำนวนดังกล่าวทำให้เกิดผลกระทบเป็นวงกว้าง ไม่สามารถขับเคลื่อนระบบวิทยาศาสตร์ วิจัยและนวัตกรรม ตามเป้าหมายที่ สกสว. ได้ตั้งไว้ จึงขอยื่นอุทธรณ์ต่อประธานกรรมาธิการวิสามัญฯ เพื่อทบทวนมติที่คณะอนุกรรมาธิการฯ ปรับลดงบประมาณดังกล่าว