- ปี 2457 โรงพยาบาลชลประทาน ถือกำเนิดจากความคิดริเริ่มของหม่อมหลวงชูชาติ กำภู อดีตอธิบดีกรมชลประทาน มีวัตถุประสงค์เพื่อเป็นสถานพยาบาลที่ให้บริการทางการแพทย์และสาธารณสุขแก่บุคลากรของกรมชลประทานที่ต้องทำงานก่อสร้างเขื่อน โดยเริ่มต้นจากการเป็นสถานพยาบาลชั่วคราว ที่ดูแลรักษาผู้ป่วยในบริเวณที่ทำการก่อสร้างเขื่อนพระราม 6 ตำบลท่าหลวง อำเภอท่าเรือ พระนครศรีอยุธยาในปี พ.ศ.2457
- ปี 2487 ได้จัดตั้งเป็นหน่วยแพทย์ในสังกัดของสำนักงานเลขานุการกรมชลประทาน ต่อมาในปี 2489 ได้ขยายตัวเป็นแผนกการแพทย์
- ปี 2493 ได้จัดตั้งเป็นกองแพทย์ในบริเวณกรมชลประทานสามเสน กรุงเทพฯ และมีสถานพยาบาลขนาดเล็กที่สามารถดูแลผู้ป่วยในได้ 20 เตียง และจัดตั้งอาคารไม้ ในบริเวณกรมชลประทาน ปากเกร็ด จังหวัดนนทบุรี ต่อมาได้ขยายตัวไปเป็นโรงพยาบาลขนาด 90 เตียง
- ปี 2498 ให้บริการรักษาผู้ป่วยทั้งที่เป็นบุคลากรของกรมชลประทาน และประชาชนทั่วไปในเขตจังหวัดนนทบุรี และจังหวัดใกล้เคียง
- ปี 2505 มีตึก 1 เป็นอาคารขนาด 2 ชั้น ซึ่งเป็นทั้งหอผู้ป่วยสามัญ ห้องผู้ป่วยฉุกเฉิน ห้อง LAB ห้องตรวจภายในและห้องคลอด ส่วน OPD เป็นเรือนไม้สีดำ มีห้องจ่ายยา ห้องทันตแพทย์ ห้องเอ็กซเรย์ และห้องผ่าตัดปี 2506 โรงพยาบาลได้สร้างตึกเพิ่มขึ้น คือตึกอำนวยการ ซึ่งเป็นตึก OPD ตั้งอยู่ทางด้านหน้า
- ปี 2510 โรงพยาบาลได้ขยายตัวไปเป็นโรงพยาบาลทั่วไป ขนาด 300 เตียง มีการสร้างทางเดินระหว่างตึก (coverway) ซึ่งขณะนั้นตึกผู้ป่วย 3 สร้างเสร็จพอดี การขนย้ายผู้ป่วยจึงสะดวกมากขึ้นเพราะเป็น coverway 2 ชั้น
- ปี 2536 ตึกผู้ป่วยพิเศษ 80 ปี ปัญญานันทะ สร้างเสร็จและเปิดให้บริการ โดยงบประมาณการก่อสร้างทั้งหมดมาจากคุณูปการของหลวงพ่อปัญญานันทภิกขุ อดีตเจ้าอาวาสวัดชลประทานรังสฤษดิ์ พระอารามหลวง
- ปี 2545 โรงพยาบาลชลประทานถูกปรับให้เป็นไปตามพระราชบัญญัติปรับปรุงกระทรวง ทบวง กรม ปี พ.ศ.2545 เมื่อวันที่ 9 ตุลาคม 2545 โดยได้ถูกโยกย้ายไปขึ้นกับสำนักงานปลัดกระทรวงสาธารณสุข มีสถานภาพเป็นโรงพยาบาลทั่วไปขนาด 300 เตียง มีสถานะเทียบเท่ากับโรงพยาบาลจังหวัด
- 7 ตุลาคม 2550 พระราชบัญญัติการโอนย้ายโรงพยาบาลชลประทานประกาศใช้ โอนย้ายโรงพยาบาลชลประทานมาสังกัดมหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ ภายใต้ปรัชญา 4 ข้อ ได้แก่ จิตอาสา ความเป็นเลิศ ดุลยภาพ และ บูรณาการ ในชื่อ ศูนย์การแพทย์ปัญญานันทภิกขุ ชลประทาน มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ เพื่อเป็นอนุสรณ์แห่งศรัทธาในหลวงพ่อปัญญานันทภิกขุ
ที่มา: ศูนย์การแพทย์ปัญญานัทภิกขุ ชลประทาน มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ
