สำหรับกรณีอุโมงค์ทางลอดแยกเกษตรอยู่ในความดูแลรับผิดชอบและบริหารจัดการโดยแขวงทางหลวงกรุงเทพ สำนักงานทางหลวงที่ 13 กรมทางหลวง โดยตรง อย่างไรก็ตาม ในช่วงเกิดเหตุ กทม. ได้รับทราบข้อมูลปัญหาน้ำท่วมภายในอุโมงค์จึงได้จัดส่งเจ้าหน้าที่สนับสนุนเข้าปฏิบัติงานอย่างเร่งด่วน โดยดำเนินการจัดเก็บขยะและสิ่งปฏิกูลที่อุดตันบริเวณช่องตะแกรงดักขยะ เพื่อเปิดทางให้น้ำไหลลงสู่ระบบสูบน้ำภายในอุโมงค์ได้รวดเร็วขึ้น
ทั้งนี้ ก่อนฝนตกได้ดำเนินการลดระดับน้ำให้อยู่ในระดับต่ำและในขณะที่เกิดฝนตกหนักในพื้นที่ได้ทำการสูบน้ำทั้งจากสถานีสูบน้ำและบ่อสูบน้ำอย่างเต็มประสิทธิภาพและต่อเนื่อง พร้อมจัดส่งหน่วยปฏิบัติงานเร่งด่วน (Best Service) ประจำจุดเสี่ยง เพื่อเร่งกำจัดสิ่งปฏิกูลหน้าตะแกรงระบายน้ำให้สามารถเร่งระบายน้ำบนถนนสายหลักฝั่งขาเข้าและควบคุมสถานการณ์จนแห้งเป็นปกติ ประชาชนสามารถใช้เส้นทางในการสัญจรผ่านไปมาได้ภายในระยะเวลาประมาณ 1-2 ชั่วโมงหลังฝนหยุดตก